1. 对营养袋内的原料彻底灭菌。培养料中的麦粒、木屑需要提前24h浸泡，使原料彻底泡透，麦粒无白芯。培养料内需要加入1%的石灰，以调节pH约在8左右。装袋时选用薄厚适合的塑料袋，防止由于木屑刺破塑料袋或摩擦产生微孔。装袋后的营养袋及时灭菌，100℃保持8h左右。搬运营养袋注意轻拿轻放，以免造成塑料袋破损。 2. 使用时，营养袋需要使开口部位贴紧土壤表面。可使用壁纸刀或粗钉板在营养袋的一个面划口或扎孔，然后将营养袋开口或扎孔的这个面水平放在土面上。放营养袋时注意需要用一定力度，以促使开口处与土壤紧密贴合，以便羊肚菌菌丝快速生长到袋内的培养料中。 3. 控制发菌温度。羊肚菌属低温真菌。温度较低时，相对杂菌生长处于优势地位。因此，放置营养袋后，要在棚前部挂一层6针遮阳网，同时也可在畦面覆盖一层黑色地膜，防止阳光直射到营养袋表面。控制棚内温度在5-22℃。 4. 加强巡查。一旦营养袋发生杂菌，根据污染程度采取相应的措施。对于羊肚菌已部分或完全吃透培养料，而仅仅少部分被污染的营养袋，可不做处理，继续观察。对于全部被杂菌污染，尤其是杂菌已从营养袋内向土壤中蔓延生长的营养袋，及时挑拣出，并在原营养袋摆放的土表撒少量生石灰，以防止杂菌蔓延。
